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Elsa Bonnafé

Elsa BONNAFE
Assistant Professor (CNU 65)
Cellular and Molecular Biology

Mon activité de recherche est centrée sur la compréhension intégrative des modifications affectant les organismes suite à des perturbations exogènes (exposition à des xénobiotiques) ou endogènes (mutations). J’ai ainsi mené une thèse de biologie moléculaire et cellulaire sur l’étude phénotypique de mutants murins pour le gène Rfx3. Cette thèse se situait dans la suite logique de ma formation suivie à l’ENS de Lyon. J’ai ensuite été recrutée en 2004 comme PRAG au sein du Centre Universitaire Champollion pour devenir Maître de conférence en septembre 2017.

À partir de 2010, j’ai proposé, en sus de mes activités d’enseignement, de nouvelles approches cellulaires et moléculaires s’intégrant aux projets nés de la structuration de la recherche en biologie.

Ainsi, depuis 2011, je suis intégrée dans différents projets d’écotoxicologie de l’équipe (axe 2) comme le projet Psycheau ( 2011-2013) porté par le PU Florence Geret concernant l’effet de l’exposition à des psychotropes retrouvés à la sortie d’une STEP d’un hôpital psychiatrique sur des mollusques d’eau douce (Corbicula fluminea) sur les gènes impliqués dans les voies de détoxification et dans les systèmes de défense antioxydant. Dans la suite de ce projet, j’ai également codirigé de novembre 2013 à mars 2017, la thèse de Jean-Yves Mazzitelli sur l’ « Evaluation de la toxicité de molécules médicamenteuses par une étude des réponses comportementales, physiologiques et métaboliques d’un mollusque dulçaquicole et d’un plathelminthe (planaire) ». Je coencadre depuis 2017 la thèse de Morgane Lebreton sur l ‘ « Evaluation des effets transgénérationnels de psychotropes, seuls ou en mélanges, sur des organismes aquatiques par des approches protéogénomiques et macroscopiques couplées » ( Projet AquaPsy). Je me suis également impliquée dans le projet BEETHYM (2012-2015) porté par le PU Michel Treilhou, projet pour lequel j’ai proposé et réalisé une étude concernant l’effet de l’exposition des abeilles à un acaricide issu de l’huile essentielle de thym, le thymol.

Depuis 2013, je suis investie dans le deuxième axe de l’équipe qui concerne l’identification et la caractérisation des effets biologiques de peptides issus de venins de fourmis exotiques. Dans ce cadre je participe au volet biologie moléculaire du projet (identification des peptides, caractérisation des voies de biosynthèse) et au volet sur la caractérisation des effets de ces peptides sur des cibles d’intérêt comme des microorganismes ou des cellules immunitaires mais également sur l’organisme producteur à savoir la fourmi. Je coencadre ainsi depuis 2017 la thèse de Valentine Barassé sur l’ « Etude des peptides de venins de fourmis : origine évolutive et lien avec la fonction immunitaire » et codirige le projet régional prématuration Pephealth dont l’objectif est d’étudier le potentiel applicatif de 10 peptides identifiés dans le venin de T. bicarinatum.

Je suis également impliqué dans de la recherche partenariale avec l’entreprise PHODE. Dans ce cadre, j’ai codirigé la thèse de Marion Allaoua (décembre 2014-mars 2018) sur l’  « étude de l’activité antimicrobienne d’extraits végétaux formulés et application en élevage de volaille ».

 

Contact:

elsa.bonnafe@univ-jfc.fr

+33 563 48 64 05

Publications

Brevets

  • Tetrapep
  • PepHealth

Revues internationale 

  • Touchard A., Tene N.,  Chan Tchi Song P., Lefranc  B., Leprince J., Treilhou M., Bonnafe E. (2018) Deciphering the molecular diversity of an ant venom peptidome through a venomics approach. Journal of Proteome Research 17 (10),  3503-3516  (DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00452)
  • Allaoua M., Etienne P., Noirot V., Carayon JL., Tene N., Bonnafe E., Treilhou M. (2018) Pharmacokinetic and antimicrobial activity of a new carvacrol-based product against a human pathogen, Campylobacter jejuni. Journal of Applied Microbiology 125 (4) 1162-1174  (DOI: 10.1111/jam.13915)
  • Mazzitelli, JY., Budzinski, H., Cachot, J., Geffard O.,  Marty P., Chiffre A., François A., Bonnafé E. , Geret F. (2018) Evaluation of psychiatric hospital wastewater toxicity: What is its impact on aquatic organisms, Environ Sci Pollut Res  25: 26090. https://doi.org/10.1007/s11356-018-2501-5
  • Benmoussa K., Authier H., Prat M., AlaEddine M., Lefèvre L., Chirine Rahabi M., Bernad J., Bonnafé E., Leprince J., Pipy B., Treilhou M., Coste A. (2017) P17, an original host defense peptide from ant venom, promotes antifungal activities of macrophages through the induction of C-type Lectin Receptors dependent on LTB4-mediated PPARγ activation. Frontiers in Immunology 8: 1650 (doi.org/10.3389/fimmu.2017.01650)
  • Benmoussa K., Authier H., Prat M., Alaeddine M., Lefèvre L., ChirineRahabi M., Bernad J., Bonnafé E., Leprince J., Pipy B., Treilhou M., Coste A. (2017) Le P17, un nouveau peptide antimicrobien, favorise l’activité antifongique des macrophages via l’induction des récepteurs Mannose et Dectine-1 et contribue à la résolution d’une candidose digestive expérimentale. Journal de Mycologie Médicale 27 (3) e11-e12. (doi.org/10.1016/j.mycmed.2017.04.033)
  • Bourioug M., Mazzitelli J.-Y., Marty P., Budzinski H., Aleya L., Bonnafé E., Geret F. (2017) Assessment of Lemna minor (duckweed) and Corbicula fluminea (freshwater clam) as potential indicators of contaminated aquatic ecosystems: responses to presence of psychoactive drug mixtures, Environmental Science and Pollution Research DOI: 10.1007/s11356-017-8447-1 (IF 2,76)
  • Mazzitelli J.-Y., Bonnafé E., Klopp C., Escudier F., Geret F. (2017) De novo transcriptome sequencing and analysis of freshwater snail (Radix balthica) to discover genes and pathways affected by exposure to oxazepam. Ecotoxicology 26, 127–140. (IF 2,32)
  • Bonnafé E., Téné N., Berger F., Rifflet A., Guilhaudis L., Ségalas-Milazzo I., Pipy B., Coste A., Leprince J., Treilhou M. (2016) Biochemical and biophysical combined study of bicarinalin, an ant venom antimicrobial peptide. Peptides 79, 103–113. (IF 2,6)
  • Bonnafé E., Drouard F., Hotier L., Carayon J.-L., Marty P., Treilhou M. Armengaud C. (2016) Monoterpenoid-based preparations in beehives affect learning, memory, and gene expression in the bee brain. Environ Toxicol Chem. DOI: 10.1002/etc.3527. (IF : 2,76)
  • Bebianno M.J., Sroda S., Gomes T., Chan P., Bonnafé E., Budzinski H., Geret F. (2016) Proteomic changes in Corbicula fluminea exposed to waste water from a psychiatric hospital, Environmental Science and Pollution Research 23, 5046–5055. (IF 2,76)
  • Bonnafé E., Sroda S., Budzinski H., Valière A., Pedelluc J., Marty P., Geret F. (2015) Responses of cytochrome P450, GST, and MXR in the mollusk Corbicula fluminea to the exposure to hospital wastewater effluents. Environmental Science and Pollution Research 22:11033–46. (IF  2,76)
  • Téne N., Roche-Chatain V., Rifflet A., Bonnafé E., Lefranc B., Leprince J., & Treilhou M. (2014) Potent bactericidal effects of bicarinalin against strains of the Enterobacter and Cronobacter genera. Food Control, 42, 202–206. DOI :10.1016/j.foodcont.2014.02.026 (IF 3,4)
  • Bonnafé E., Drouard F., Hotier L., Carayon J.-L., Marty P., Treilhou M., & Armengaud C. (2015) Effect of a thymol application on olfactory memory and gene expression levels in the brain of the honeybee Apis mellifera. Environmental Science and Pollution Research. 22(11) 8022-30. (IF 2,76)
  • Carayon J.-L., Téné N., Bonnafé E., Alayrangues J., Hotier L., Armengaud C., & Treilhou M. (2013) Thymol as an alternative to pesticides: persistence and effects of Apilife Var on the phototactic behavior of the honeybee Apis mellifera. Environmental Science and Pollution Research. 21(7):4934-9. DOI: 10.1007/s11356-013-2143-6 (IF 2,76)
  • Baas D., Meiniel A., Benadiba C., Bonnafé E., Meiniel O., Reith W., & Durand B. (2006) A deficiency in RFX3 causes hydrocephalus associated with abnormal differentiation of ependymal cells. The European journal of neuroscience, 24(4), 1020–30. (IF 3,26)
  • Bonnafé E., Touka M., AitLounis A., Baas D., Barras E., Ucla C., Moreau A., Flamant F., Dubruille R., Couble P., Collignon J., Durand B., R. W. (2004) The transcription factor RFX3 directs nodal cilium development and left-right asymmetry specification. Molecular and cellular biology, 24(10), 4417–4427. (IF 4,43)